Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地绘制出人类消化系统的微生态系统目录!

2022-01-10 00:08:31 来源:
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近日,一项刊登在国际新闻周刊Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的研究成果报告里,来自欧洲分子生物科学Laboratory等机构的化学家们通过研究成果将生命体磨碎系统病原体组成员里所有已知的酵母菌线粒体编撰成了一个大型的资料库,从而就能希望研究成果职员深入即使酵母菌基因和蛋白间的相关联,以及其对生命体健康的影响。

酵母菌遍布人体液外,其能够产生核糖体来影响本机磨碎、健康和对疾病的易感性,其如此相比较以至于人体病原体组成员成员的存量要比人线粒体还要多,除此以外酵母菌、真菌和其它病原体;为了理解酵母菌在生命体生物科学里所充当的关键性角色,化学家们通常会在Laboratory里复合并对其培养,随后在对酵母菌来进行DNA人类基因组成员计划,然而目前很多酵母菌还无法在Laboratory的环境里被培养繁殖。

为了赢取这些酵母菌的就其资讯,研究成果职员采取了另外一种原理,他们从环境里(比如磨碎系统)收集单一比对,随后在对整个比对里的DNA来进行人类基因组成员计划,然后利用计算机原理对来自单一比对里的数千种品种的个体线粒体来进行扩建,这种原理被叫作宏线粒体学新技术,该新技术能作为一种替代原理对单个品种的DNA来进行复合和人类基因组成员计划。

研究成果者Rob Finn说明,去年除此以外我们在内的三个独立团队扩建了有数个磨碎系统病原体组成员线粒体,而较大的问题就是这些团队所得到的结果应该具有可比性,以及应该能将这些结果编撰成为一个非常全面的名册。目前研究成果职员已经从生命体磨碎系统里最少4600种酵母菌分布区里编撰了20万个线粒体和1.7亿个核糖体碱基,这种新型的资料库(独立的生命体磨碎系统线粒体集合和独立的磨碎系统核糖体附录)揭示了本机磨碎系统的巨大动植物,并为更进一步来进行磨碎系统病原体组成员研究成果走上了道路。

研究成果者绘成借助于的这个巨大的附录是病原体组成员研究成果的一个典范,未来会或将能为化学家们提供非常宝贵的能源来研究成果生命体磨碎系统生态系统里每一种酵母菌所充当的关键性角色。这项研究成果表明,最少70%被检测到的酵母菌从而在Laboratory里被最终培养过,而其在体液的活性仍然可能,而这类酵母菌里较大的个体就是Comantemales;研究成果者说明,看到Comantemales如此广泛敢说一个惊喜,这就突显借助于了我们的确对磨碎系统里的酵母菌知之甚少,我希望这个附录能希望生物资讯学家和分子生物化学家在未来会几年补救这一科学知识空白。

该资料库/附录收集的所有数据都能在Skype能源Mgnify里赢取,其能希望化学家们数据分析病原体的线粒体数据并且与当前的资料库来进行对比;随着世界各地研究成果团队不断释借助于新的资料库,该附录不会缩小到除此以外其它本机指甲的病原体组成员,比如肌肤或口腔内部等指甲。就此研究成果者说明,这一附录的编撰未来会或为病原体化学家和临床试验者职员提供非常丰富的能源,然而研究成果职员不会在南美洲、亚洲和非洲大陆等代表性不足的地区断定更多新的酵母菌品种,目前研究成果职员并不清楚不同人群里酵母菌动植物的差异和变化情形。

许多现代借助于处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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